本寺相傳創建於明永曆年間(西元1647∼1661年) ，初稱「彌陀室」。入清以後，屢有重修擴建，更名 為「彌陀寺」，為府城七寺八廟之一。 　　日據時期因戰火之故，多所破損。直到民國五十 四年住持圓斌法師發願，邀集眾信重整寺院，經多年 儲資，終在民國六十年開始動工修建，歷經十年於六 十九年底，峻工落成，從此道場煥然一新。